一种蛋白质-配体结合位点与亲和力预测方法及系统

本发明公开了一种蛋白质‑配体结合位点与亲和力预测方法及系统，属于生物信息学与计算机深度学习技术领域。方法包括：采集并处理蛋白质的PDB格式文件以及配体的SDF格式文件，得到批处理后图数据张量；构建复合型编码器，将所述批处理后图数据张量输入至所述复合型编码器中，得到分子内部和分子间的节点特征和边特征；构建混合块注意力模块，基于所述混合块注意力模块对分子内部和分子间的所述节点特征和所述边特征进行处理，得到注意力输出；基于所述注意力输出得到预测结果，并基于预测结果对亲和力值进行预测。本发明引入了MoBA适配器，通过分块处理和Top‑K注意力机制，有效处理大规模分子数据，同时保持计算效率。