一种基于三维堆叠空间转录组数据虚拟器官模拟方法及系统

本申请提供了一种基于三维堆叠空间转录组数据虚拟器官模拟方法及系统，该方法包括：根据若干空间转录组切片数据的坐标信息构建空间邻接网络；采用图注意力自编码器对空间邻接网络中每个点位进行表达嵌入表示学习；对各切片的三维坐标进行体素化处理，通过高斯平滑构建连续体，生成三维形态模型；对潜在空间扩散模型进行训练，生成空间转录组数据的潜在表达；对于给定的坐标和条件，从训练好的潜在空间扩散模型中采样生成嵌入向量，将嵌入向量输入图注意力自编码器，得到对应点位的基因表达谱。本申请的优势在于：对整器官甚至跨组织区域的空间转录组进行统一建模与表达生成，突破了现有方法仅限于局部区域或单切片的小规模建模能力。