摘要
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及SNP分子标记组合及其在罗非鱼品种/品系鉴定中的应用。本发明构建了覆盖7个罗非鱼品种/品系的全基因组SNP变异图谱,通过机器学习算法筛选出40个用于种质鉴定的核心SNP分子标记,构建的分类模型准确率高达99.61%。在此基础上,进一步优化出24个KASP分子标记位点并开发配套分型方法,在目标群体中实现95.08%~98.17%的平均分型成功率,品种/品系鉴定准确率达98.6%。本发明将机器学习算法应用于罗非鱼种质鉴定,支持动态扩展SNP面板以纳入新品种/品系,为罗非鱼保种选育、苗种纯度控制及数字化管理提供了高效标准化工具。
技术关键词
SNP分子标记组合
红罗非鱼
尼罗罗非鱼
机器学习算法
遗传变异图谱
奥利亚罗非鱼
误差反向传播神经网络
全基因组测序数据
种质鉴定
位点
SNP基因型
梯度提升决策树
标准化工具
引物
训练分类模型
逻辑回归模型
朴素贝叶斯
分型方法
支持向量机
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词语
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