摘要
本发明公开一种基于多属性约束的分子生成方法及装置,属于分子设计与生成技术领域;方法包括:将REINVENT4作为分子生成基础架构,构建预训练模型;将预训练模型的强化学习训练过程划分为多个阶段,并在每个阶段固定训练M步;在强化学习训练过程中,设定成药性关键指标作为基础优化目标,并分别引入片段奖励机制和潜在向量密度奖励机制,引导模型生成结构新颖的分子;利用强化学习训练后的模型生成分子,并使用Lipinski规则、拓扑极性表面积以及合成可行性评分对分子进行筛选;通过Bloom Filter去除重复分子,构建虚拟化合物库。该虚拟化合物库总的分子结构新颖、成药性良好、分布广泛,可广泛应用于多靶点、多任务的虚拟筛选流程中,降低了分子生成的计算成本。
技术关键词
分子
生成方法
预训练模型
生成结构
机制
阶段
通信接口
化合物库
计算机存储介质
生成技术
密度
计算机程序产品
指标
供体
存储器
生成装置
处理器
指令
模块
多任务
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仓库
图像处理模型
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参数
管理方法
分支
样本
区域建议网络
多尺度特征
少量标注数据
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低压台区拓扑识别
周期性特征
注意力机制
依赖特征
像素点
边缘检测算法
决策融合方法
邻域
高斯平滑滤波