一种检测与农艺性状有互作效应的核质基因位点的方法

本发明涉及一种检测与农艺性状有互作效应的核质基因位点的方法，包括将核基因组SNP数据和线粒体基因组SNP数据进行两两配对，计算其与每个线粒体基因组SNP的核质之间的遗传连锁不平衡系数，以每个核基因组SNP为核心，筛选出连锁强度异常突出的核基因组SNP和线粒体基因组SNP配对作为候选核质互作耦联对，构建混合线性模型来实施GWAS分析，筛选与农艺性状有互作效应的核质基因位点。本发明筛选出与待测农艺性状具有高关联性的核质基因位点，可以大大减少分析所需算力和时间，减轻作物农艺性状的分子遗传研究的工作量。本发明的方法通过软件进行分析获得结果，分析步骤简单，耗时短，对核质基因位点检测准确，应用范围广。