一种利用高通量测序检测食管-胃腺癌早期患者血浆cfDNA特有菌群的方法

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一种利用高通量测序检测食管-胃腺癌早期患者血浆cfDNA特有菌群的方法
申请号:CN202410726374
申请日期:2024-06-06
公开号:CN118726620A
公开日期:2024-10-01
类型:发明专利
摘要
本发明提供了一种利用高通量测序检测食管‑胃腺癌早期患者血浆cfDNA特有菌群的方法,具体步骤如下:S1.样本血浆中cfDNA提取;S2.NGS文库制备及测序;S3.数据的处理和对齐;S4.微生物丰度估算;S5.结果汇总,对于不确定的丰度差异指标,可使用定量PCR进行验证。本发明是利用食管‑胃腺癌早期患者外周血中的细菌核酸,通过宏基因组测序技术和生物信息学分析的方法,对外周血中肿瘤特有的细菌核酸进行快速、准确和敏感的检测。
技术关键词
检测食管 高通量 患者 基因组测序技术 文库 信息分析技术 期望最大化算法 样本 引物 序列 对外周血 过滤器 覆盖率 核酸提取 试剂盒 高丰度 软件 接头
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