一种基于深度学习算法预测pre-mRNA剪切的方法及系统

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一种基于深度学习算法预测pre-mRNA剪切的方法及系统
申请号:CN202411049190
申请日期:2024-08-01
公开号:CN119181423A
公开日期:2024-12-24
类型:发明专利
摘要
本申请涉及RNA剪切与深度学习技术领域,具体而言,涉及一种基于深度学习算法预测pre‑mRNA剪切的方法及系统,一定程度上可以解决现有方法,对于隐性的非经典的剪切位点预测能力较弱,在真实数据集上的准确率并不理想,预测速度较慢的问题。方法包括:基于公共数据库及RNA‑seq测序数据集,获取pre‑mRNA序列数据,同时标定pre‑mRNA序列数据中的剪切位点及非剪切位点;对pre‑mRNA序列数据进行预处理,得到生成模型所需的数据集,数据集包括训练集、验证集及测试集;搭建卷积神经网络与自注意力机制结合的神经网络模型,并使用训练集及验证集训练神经网络模型,得到最优神经网络模型;采用最优神经网络模型对测试集进行三分类预测,得到供/受体剪切位点及非剪切位点的概率。
技术关键词
深度学习算法 序列 位点 注意力机制 数据 残差网络 突变型 制作标签 神经网络模型训练 编码 训练神经网络模型 训练集 深度学习技术 受体 模块 格式 超参数 基因
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