摘要
本发明公开了一种基于多模态数据融合的药物协同组合预测方法,首先获取药物组合样本的药物特征向量和细胞系基因表达量;接着基于多头自注意力的图注意力网络和最大池化操作提取药物特征向量中的药物分子图特征;再基于可变形卷积网络提取药物特征向量中的药物摩根指纹特征,并通过空间重建模块抑制药物摩根指纹特征的冗余;然后基于多层感知机提取细胞系基因表达量中的细胞系特征;最后采用Transformer将药物分子图特征、重建后的药物摩根指纹特征和细胞系特征进行特征融合,得到药物协同组合预测结果。本发明通过融合药物的多模态数据,增强了模型对药物的表征能力,进而提高了对未知药物协同组合的预测精度和泛化能力。
技术关键词
指纹特征
药物
组合预测方法
多模态数据融合
细胞系
可变形卷积网络
注意力
基因
多层感知机
分子
sigmoid函数
节点
样本
表达式
归一化方法
矩阵
网格
输出特征
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