一种基于图神经网络的环状RNA预测疾病的方法

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正文
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一种基于图神经网络的环状RNA预测疾病的方法
申请号:CN202411489525
申请日期:2024-10-23
公开号:CN119274649A
公开日期:2025-01-07
类型:发明专利
摘要
本发明涉及生物信息学技术领域,提出了一种由原始通道和交互通道构成的CDA预测模型。首先从circ2Disease与circR2Disease俩个开源数据库中获取原始数据。将原始数据加工,筛选出人类的circRNA和疾病关联并构造稀疏矩阵,基于稀疏矩阵进行多种相似度计算获取初始特征,随后进入两个通道:在通道一中使用双注意力机制,提取高阶特征并保留重要信息;在通道二中,使用度分割和Wave模块,融合不同样本特征的潜在信息关联。随后,通过通道融合模块整合俩通道信息以生成最终输出,最后通过五折交叉验证以及评估指标来找到性能最优的模型。基于两个数据集的实验结果表明,该模型在CDA预测任务中的性能优于现有方法,进一步的案例研究和泛化分析验证了其有效性和广泛适用性。
技术关键词
矩阵 开源数据库 疾病 注意力机制 生物信息学技术 环状 语义 双通道模型 补丁 样本 融合方法 模块 人类 指标 图书馆 医学 训练集 曲线
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