摘要
本申请提供一种基于人工智能的酶改造方法,包括:对AlphaFold2模型进行训练得到糖基转移酶三级结构预测模型;基于活性点位识别模型,对蛋白质和核酸序列数据库和非冗余蛋白质特征序列数据库进行多序列比对,得到比对结果;初始化一个与比对结果长度相等的矩阵,以构建PSSM矩阵以及筛选出潜在突变位点;根据筛选出的潜在突变位点,构建初始突变库以形成虚拟筛选突变库;基于糖基转移酶三级结构预测模型对虚拟筛选突变库中的序列进行结构重建,以预测糖基转移酶三级结构并对其进行分子对接和动力学模拟,以分析蛋白与配体的结合口袋以及确定其中氨基酸残基与配体的动态相互作用、每个氨基酸残基与配体的接触数量以对糖基转移酶三级结构进行改造。
技术关键词
改造方法
动态相互作用
矩阵
配体
位点
核酸
冗余
口袋
序列比
蛋白
频率
多模态
分子
三维结构
融合特征
底物
度量
关系
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