一种在线整合多来源单细胞数据的方法及系统

本发明涉及生物学信息技术领域，尤其涉及一种在线整合多来源单细胞数据的方法及系统。该方法包括以下步骤：获取多源的单细胞转录组数据；对单细胞转录组数据进行基于基因表达量、线粒体基因比例以及细胞数据深度的数据质量评估，得到初始质控数据；根据初始质控数据设置标准化过滤参数，并对单细胞转录组数据进行质控参数过滤，得到过滤细胞数据；对过滤细胞数据进行基因表达特征分析，生成高变异基因表达特征数据；根据高变异基因表达特征数据进行基因表达时空分布统计，生成基因表达统计特征数据。本发明通过精细化的质控和批次效应校正，能够在保证数据质量的前提下，将不同来源的数据进行无缝整合，从而消除不同批次和技术平台带来的噪音。