摘要
本发明公开了一种基于超图和主动学习的药物‑靶标相互作用预测方法,大致分为以下步骤:利用药物‑靶标已知关联、药物‑药物相互作用以及靶标‑靶标相互作用构建药物‑靶标邻接矩阵;根据药物‑靶标已知关联矩阵构造药物超图和靶标超图;将药物和靶标的初始特征嵌入分别输入双路径信息传递网络中,引入对比学习机制来优化表征;使用基于Transformer的语义特征融合模块来聚合局部特征和全局特征;将最终的节点特征输入到多层感知机来预测药物‑靶标相互作用;从负样本池中根据查询策略选择部分负样本,更新训练集。本发明在模型层面实现轻量化设计,提出了基于主动学习的负样本选择策略,通过不断迭代来优化训练集中的负样本,提高了模型性能。
技术关键词
药物
靶标相互作用
查询策略
样本
矩阵
多层感知机
语义特征
嵌入特征
主动学习算法
主动学习策略
超参数
节点特征
定义
邻居
贝叶斯模型
网络
双线
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计划
推荐系统算法
风险预测模型
深度学习分类
终端
城市轨道交通客流
客流预测方法
Attention机制
交叉注意力机制
场景特征
指标
样本生成方法
编码特征
模型训练方法
排序模型