一种基于层次聚类及多任务和谐搜索算法的高阶SNP相互作用检测方法、电子设备

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一种基于层次聚类及多任务和谐搜索算法的高阶SNP相互作用检测方法、电子设备
申请号:CN202411839467
申请日期:2024-12-13
公开号:CN119785876A
公开日期:2025-04-08
类型:发明专利
摘要
本发明涉及一种基于层次聚类及多任务和谐搜索算法的高阶SNP相互作用检测方法、电子设备,属于生物遗传学技术领域。本发明包括:构建高阶SNP相互作用的模拟数据集;使用层次聚类对模拟数据集进行聚类;在聚类的基础上对和声库进行簇间和簇内部聚类初始化;开始迭代并通过多任务框架实现不同任务之间的知识迁移;迭代过程中通过多个目标函数从若干个方面刻画高阶SNP组合与疾病状态的关系,将更优解放入候选解集合;通过G‑test对迭代结束后的候选解集合进行筛选得到高阶SNP相互作用集合;本发明在46个模拟数据集上做了实验,采用对比算法和本发明进行对比,该方法取得了最佳的效果。
技术关键词
搜索算法 多任务 生物遗传学技术 非暂态计算机可读存储介质 基因 样本 层次聚类算法 元素 矩阵 疾病 电子设备 处理器 定义 计算机程序产品 数据 度量 存储器 框架 基础
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