摘要
本发明涉及一种基于层次聚类及多任务和谐搜索算法的高阶SNP相互作用检测方法、电子设备,属于生物遗传学技术领域。本发明包括:构建高阶SNP相互作用的模拟数据集;使用层次聚类对模拟数据集进行聚类;在聚类的基础上对和声库进行簇间和簇内部聚类初始化;开始迭代并通过多任务框架实现不同任务之间的知识迁移;迭代过程中通过多个目标函数从若干个方面刻画高阶SNP组合与疾病状态的关系,将更优解放入候选解集合;通过G‑test对迭代结束后的候选解集合进行筛选得到高阶SNP相互作用集合;本发明在46个模拟数据集上做了实验,采用对比算法和本发明进行对比,该方法取得了最佳的效果。
技术关键词
搜索算法
多任务
生物遗传学技术
非暂态计算机可读存储介质
基因
样本
层次聚类算法
元素
矩阵
疾病
电子设备
处理器
定义
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数据
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