一种基于加权基因共表达网络分析挖掘遮阴条件下调控香果树非结构性碳水化合物分配关键基因的方法

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一种基于加权基因共表达网络分析挖掘遮阴条件下调控香果树非结构性碳水化合物分配关键基因的方法
申请号:CN202411840381
申请日期:2024-12-13
公开号:CN119851756A
公开日期:2025-04-18
类型:发明专利
摘要
本发明涉及一种基于加权基因共表达网络分析挖掘遮阴条件下调控香果树非结构性碳水化合物分配关键基因的方法,包括如下步骤:S1、获得不同光照条件下香果树根、茎、叶样品;S2、非结构性碳指标测定以及转录组测序;S3、建立加权基因共表达网络模型,划分为多个基因模块;计算基因模块特征基因与非结构性碳指标的相关性,筛选关键基因模块;对关键基因模块进行基因连接度计算和基因功能注释,筛选关键基因。本发明成功挖掘鉴定19个参与遮荫条件下调控香果树非结构性碳分配的关键候选基因,为进一步阐明香果树高光胁迫响应的分子机制奠定了基础,也为开发有效的香果树保育技术、促进香果树种群恢复提供了理论支持,具有重要的意义。
技术关键词
基因共表达网络 转录组测序 香果树幼苗 网络分析 碳水化合物 模块 指标 淀粉 保育技术 光照 数据 液氮 机制 理论 算法 分子 平台
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