摘要
本发明提供了人类白细胞抗原I类分子与肽段结合亲和力的预测方法,其构建方法为获取人类白细胞抗原I类分子的抗原结合位点残基,通过二次多序列比对,提取出人类白细胞抗原I类分子抗原结合区域序列;随后基于配对的人类白细胞抗原I类分子‑肽段,分别生成人类白细胞抗原I类分子编码矩阵和肽段编码矩阵;然后构建卷积神经网络的模型,以量化人类白细胞抗原I类分子与肽段结合亲和力得分。本发明结合了氨基酸的理化特征、人类白细胞抗原I类分子互补表位序列、序列间相互作用关系,开发了一种基于卷积神经网络预测人类白细胞抗原I类分子与肽段结合亲和力的方法。
技术关键词
人类白细胞抗原
亲和力
分子
矩阵
构建卷积神经网络
序列特征
表位序列
理化特征
处理器
计算机程序产品
注意力机制
预测装置
编码模块
存储器
指令
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