人类白细胞抗原I类分子与肽段结合亲和力的预测方法

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人类白细胞抗原I类分子与肽段结合亲和力的预测方法
申请号:CN202411880842
申请日期:2024-12-18
公开号:CN119339780B
公开日期:2025-04-22
类型:发明专利
摘要
本发明提供了人类白细胞抗原I类分子与肽段结合亲和力的预测方法,其构建方法为获取人类白细胞抗原I类分子的抗原结合位点残基,通过二次多序列比对,提取出人类白细胞抗原I类分子抗原结合区域序列;随后基于配对的人类白细胞抗原I类分子‑肽段,分别生成人类白细胞抗原I类分子编码矩阵和肽段编码矩阵;然后构建卷积神经网络的模型,以量化人类白细胞抗原I类分子与肽段结合亲和力得分。本发明结合了氨基酸的理化特征、人类白细胞抗原I类分子互补表位序列、序列间相互作用关系,开发了一种基于卷积神经网络预测人类白细胞抗原I类分子与肽段结合亲和力的方法。
技术关键词
人类白细胞抗原 亲和力 分子 矩阵 构建卷积神经网络 序列特征 表位序列 理化特征 处理器 计算机程序产品 注意力机制 预测装置 编码模块 存储器 指令
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