保加利亚乳杆菌与嗜热链球菌二对二互作预测及筛选方法

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保加利亚乳杆菌与嗜热链球菌二对二互作预测及筛选方法
申请号:CN202510029908
申请日期:2025-01-08
公开号:CN119889483B
公开日期:2025-08-26
类型:发明专利
摘要
本发明提供了一种保加利亚乳杆菌与嗜热链球菌二对二互作预测及筛选方法,属于食品生产技术领域。该方法通过计算两株保加利亚乳杆菌和两株嗜热链球菌的全基因组k‑mer数据,形成各自的特征向量,并计算基因拷贝数以构建KEGG矩阵。通过合并KEGG特征和k‑mer特征频次,生成综合特征向量。利用卡方检验、梯度提升和方差分析,从真实标签样本中筛选出前200个重要特征。接着,通过生成对抗网络(GAN)生成伪标签样本,结合真实标签样本构建机器学习模型,用于预测菌株组合的互作效果。最后,通过发酵试验验证模型预测的准确性,并选出最优模型。本发明能够高效预测菌株组合的互作共生潜力,提高酸奶生产的效率和品质。
技术关键词
保加利亚乳杆菌 构建机器学习模型 筛选方法 拷贝数 嗜热链球菌 标签 样本 特征选择方法 朴素贝叶斯 生成对抗网络 基因 支持向量机 K近邻 随机森林 数据 矩阵 酸奶 列表 逻辑
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