一种化学品对DNA促旋酶A亚基的抑制活性预测方法

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一种化学品对DNA促旋酶A亚基的抑制活性预测方法
申请号:CN202510047498
申请日期:2025-01-13
公开号:CN119851809B
公开日期:2025-10-03
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种化学品对DNA促旋酶A亚基的抑制活性预测方法,该方法包括:从公共数据库获取化学品结构及其对DNA促旋酶A亚基的抑制活性数据,并进行结构清洗与缩放,再将获得的已知数据分为训练集和测试集;构建以化学品SMILES码为输入的图神经网络模型;使用训练集通过交叉验证确定图神经网络模型的最优超参数,以获得最优的抑制活性预测模型;利用抑制活性预测模型获取待评价化学品对DNA促旋酶A亚基的抑制活性数据缩放值的预测值。本发明仅输入化合物分子结构即可预测环境化学品能对DNA促旋酶A亚基的抑制作用,实现污染物可能诱导细菌喹诺酮耐药性的分子起始事件的快速筛查,具有广阔的应用前景。
技术关键词
神经网络模型 模型超参数 活性预测方法 注意力 编码器 数据 节点特征 序列 化合物分子结构 多层感知机 交互特征 模块 矩阵 索引 去离子 邻域 共价键
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