一种筛选跨物种HGT的方法

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一种筛选跨物种HGT的方法
申请号:CN202510103119
申请日期:2025-01-22
公开号:CN119943151B
公开日期:2025-09-23
类型:发明专利
摘要
本发明属于生物信息学技术领域,具体涉及一种筛选跨物种HGT的方法。该方法包括构建背景数据库、推断同源组、构建基因系统发育树、基于基因树的HGT推断、基于基因树推断候选HGT的验证、将HGT分配到时间线等步骤。该方法通过整合系统发育分析、序列比对、基因功能注释以及统计验证等多步骤流程,实现了对大量基因数据集中HGT事件的高通量、自动化筛选。本发明的方法特别适用于跨越生物界的超长时间长度和超远进化距离的HGT研究,能够为理解生物进化历程中的基因流动和功能增强提供重要的科学工具。
技术关键词
基因 序列 系统发育树 系统发育谱系 分类边界 染色体 生物信息学技术 转录组测序 指数 聚类算法 供体 无监督 高通量 嵌套 分支 网络 座位 家族 海洋
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