摘要
本发明公开了一种基于机器学习筛选抗HBV活性的FXR调节剂的方法。收集FXR调节剂化合物,基于机器学习方法构建分类预测模型,并利用分子指纹描述符对SVM和RF预测模型的预测效果进行分别计算和评估;使用预测性能更优的RF预测模型对药物库(FDA_HY‑L022 Library)中的分子进行FXR调节活性预测;对预测活性概率较高的化合物进行分子对接分析;对FXR调节活性进行实验检测。本发明构建的FXR调节剂虚拟筛选模型AUC值达到0.93,表现出对数据集的良好预测能力,且通过细胞实验验证了模型的准确性。此外,使用HepG2.2.15细胞模型进行的抗HBV活性测试,发现了6个既具有较强FXR调节活性又具有一定HBV复制抑制活性的分子。
技术关键词
FXR调节剂
稳定表达荧光素酶
机器学习方法
化合物库
虚拟筛选模型
训练特征
指纹
FXR激动剂
描述符
分子对接技术
分类预测模型
机器学习模型
细胞模型
数据
标签
聚类
亲和力
复合物
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性能指标数据
深度神经网络模型
构建深度神经网络
防结块
工艺参数配置
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强化学习算法
机器学习方法
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预测模型构建方法
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牵引设备
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