一种lncRNA基因序列与蛋白质相互作用预测方法及系统

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一种lncRNA基因序列与蛋白质相互作用预测方法及系统
申请号:CN202510117225
申请日期:2025-01-24
公开号:CN120072038A
公开日期:2025-05-30
类型:发明专利
摘要
本发明涉及生物信息学技术领域,公开了一种lncRNA基因序列与蛋白质相互作用预测方法及系统,方法包括获取lncRNA和miRNA的序列数据,以及蛋白质数据;计算lncRNA、miRNA和蛋白质的相似性,以lncRNA、miRNA和蛋白质为节点,lncRNA、miRNA和蛋白质之间的相似性关系为边,构建异构信息网络;根据元路径,从异构信息网络提取子图,并对子图进行图卷积操作,生成lncRNA、miRNA和蛋白质的特征表示;对lncRNA、miRNA和蛋白质的特征表示进行融合处理,得到融合特征表示;将融合特征表示输入训练好的预测模型进行预测,得到lncRNA与蛋白质相互作用的预测结果。本发明在多样化数据集上的适应性增强,能够更准确地预测lncRNA与蛋白质之间的相互作用,有效提高lncRNA与蛋白质相互作用预测的准确性。
技术关键词
蛋白质相互作用预测方法 异构信息网络 上下文特征 融合特征 嵌入特征 序列 矩阵 基因 表达式 节点特征 高斯核函数 输出特征 生物信息学技术 本体论 语义注意力 多头注意力机制 潜在交互 训练样本集
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