异源基因优化方法及装置

本发明公开了一种异源基因优化方法及装置，该方法包括：将异源基因中每种密码子进行矩阵转化，得到简并矩阵，所述简并矩阵的每个元素用于表示异源基因序列中的密码子所编码的氨基酸残基上存在任一密码子的概率；以简并矩阵为输入，训练自注意力神经网络模型，获得训练好的自注意力神经网络模型；所述自注意力神经网络模型在训练时的损失函数包括密码子适应指数损失函数、tRNA适应指数损失函数、核糖体平均解码速率损失函数和最小自由能损失函数中的任意组合；在获得待优化的异源基因序列后进行矩阵转化，得到待分析的异源基因序列的简并矩阵，并输入至训练好的自注意力神经网络模型中，获得优化后的异源基因序列。效率高，且优化效果好。