摘要
本发明涉及一种基于可解释人工智能的体细胞突变检测的方法、装置和计算机存储介质,属于基因检测技术领域。使用二代测序技术,对肿瘤‑对照样本进行全外显子组测序。利用多种体细胞变异检测工具分析的突变数据作为输入特征,计算并提取每种检测工具的偏差值var=(|FP‑FN|)/(TP+FP)作为响应变量。基于H2O AutoML框架,整合集成建模和模拟退火算法,动态选择针对单样本的最佳变异检测工具组合策略,解决了肿瘤突变负荷评估中包括测序深度、肿瘤纯度和突变检测算法多样化挑战。相较于经典体细胞变异检测工具,展现出卓越的预测性能和稳健性。其可解释性为复杂的机器学习模型提供了必要的透明度,填补了计算输出与临床解释之间的空白,促进了其在转化研究和临床决策中的应用。
技术关键词
体细胞
检测工具
可解释人工智能
构建机器学习模型
偏差
软件
计算机存储介质
样本
模拟退火算法
矩阵
工具组合
变量
肿瘤突变负荷
二代测序技术
基因检测技术
测序装置
核苷酸
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