基于环状DNA富集测序的瘤内菌检测、分析方法以及相关模型构建

本发明提供了基于环状DNA富集测序的瘤内菌检测、分析方法以及相关模型构建，属于分子生物学领域。本发明提供的瘤内菌检测方法包括：提取癌组织或癌旁组织总DNA进行线性消化，纯化线性消化产物，富集得到环状DNA；扩增环状DNA，并将DNA扩增产物打断至300～500bp；纯化DNA片段，构建文库，测序；根据测序结果进行基因组比对，获得瘤内菌信息。该方法能捕获完整的细菌基因组及质粒基因组信息，提高瘤内菌检测的灵敏度和细菌基因组信息的丰富度。本发明还进一步提供了瘤内菌分析方法，可筛选泛癌细菌标志物，并提供了基于瘤内菌的癌症风险评估机器学习模型，提高了瘤内菌临床应用的可能性。