一种适用于豆科根瘤器官单细胞空间转录组三维重构的方法

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一种适用于豆科根瘤器官单细胞空间转录组三维重构的方法
申请号:CN202510708911
申请日期:2025-05-29
公开号:CN120808881A
公开日期:2025-10-17
类型:发明专利
摘要
本发明涉及一种适用于豆科根瘤器官单细胞空间转录组三维重构的方法,其包括将单细胞数据和空间组数据整合,然后再整合X射线成像数据的步骤,任选地,单细胞数据的获得通过snRNA‑seq技术进行,任选地,空间组数据的获得通过Stereo‑seq技术进行。本发明用于对植物根瘤进行三维基因表达图谱构建,将三种技术的优势结合在一起,允许用户以三维方式探索根瘤细胞群组成和基因表达模式。
技术关键词
X射线成像数据 Louvain算法 乙醇 单细胞转录组数据 冷冻切片 真空渗透 丙酮 组织 基因表达图谱 条码 基因表达模式 文库 差异表达基因 空间坐标信息 自定义脚本 重构
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