基于图神经网络的食管癌RNA-蛋白互作空间预测方法及装置

本申请涉及生物信息学技术领域，具体而言，涉及一种基于图神经网络的食管癌RNA‑蛋白互作空间预测方法及装置，一定程度上可以解决传统方法，难以精准区分癌组织与正常组织在RPI上的差异的问题。该方法包括：获取食管癌相关的多阶段空间转录组数据，并进行预处理，以得到多模态特征张量及癌变阶段标签；利用所述多模态特征张量与所述癌变阶段标签，以RNA和蛋白为节点，基于序列互补性和结构匹配度定义静态边，基于空间共表达相关性定义动态边，构建随癌变阶段更新的时空动态图；所述时空动态图作为输入，通过时空双分支编码和注意力机制融合特征，预测互作存在性、位点坐标及结合能，输出互作预测结果。