一种蛋白质相互作用位点预测方法及系统

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一种蛋白质相互作用位点预测方法及系统
申请号:CN202511024282
申请日期:2025-07-24
公开号:CN120877854A
公开日期:2025-10-31
类型:发明专利
摘要
本发明涉及生物信息技术领域,尤其涉及一种蛋白质相互作用位点预测方法及系统。本发明根据蛋白质的序列和结构,提取蛋白质残基特征;利用蛋白质结构构建邻接矩阵,通过集成拉普拉斯特征向量和随机游走,充分表征残基图结构;将残基特征与残基图结构特征拼接作为节点特征,并与邻接矩阵共同构成蛋白质图表征;通过由多个局部结构与全局交互模块构成的残基特征提取模块,进一步学习残基高阶特征,每个局部结构与全局交互模块由残差连接的等变图神经网络和残差连接的空间感知Transformer串联构成;通过多层感知机,对每个残基是否是相互作用位点进行预测分类。本发明充分利用了蛋白质的局部结构信息与全局信息,提高了蛋白质相互作用位点预测的准确性。
技术关键词
位点预测方法 多头注意力机制 夹角余弦 矩阵 特征提取模块 多层感知机 拉普拉斯 节点特征 元素 坐标 生物信息技术 蛋白 特征值 前馈神经网络 数据获取模块 预测系统
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