一种基因序列匹配方法、系统、计算机设备及存储介质

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一种基因序列匹配方法、系统、计算机设备及存储介质
申请号:CN202511032538
申请日期:2025-07-25
公开号:CN120877868A
公开日期:2025-10-31
类型:发明专利
摘要
本发明提供了一种基因序列匹配方法、系统、计算机设备及存储介质,属于计算机领域,包括:获取待处理的DNA序列;定义主串S和子串T,确定主串S和子串T存储下标从1开始进行匹配,得到基因序列匹配结果;其中,主串S为完整的DNA序列,子串T为特定的基因片段;其中,当主串S与子串T在第p个字符和第q个字符匹配失败时,利用子串T内部结构信息,通过部分匹配表确定子串T新的比较位置。本发明在匹配失败时,利用部分匹配表(next数组)避免主串指针回溯,有效减少了冗余的字符比较操作,避免了在匹配过程中进行大量重复计算,使得整个基因序列匹配过程更加高效,大幅提升了字符串匹配效率,尤其在处理长字符串和大规模数据时优势显著。
技术关键词
序列 基因 字符 计算机设备 数据获取模块 生成算法 匹配模块 处理器 指针 定义 可读存储介质 存储器 冗余
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