一种转录因子结合位点预测方法及系统

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一种转录因子结合位点预测方法及系统
申请号:CN202410754983
申请日期:2024-06-12
公开号:CN118629495A
公开日期:2024-09-10
类型:发明专利
摘要
本发明提供一种转录因子结合位点预测方法及系统,方法包括:在不同DNA序列上应用滑动窗口来生成丰富的序列特征,接着对这些特征进行综合处理和编码,以形成详细的特征表示。最后,通过运用多尺度卷积神经网络CNN和conformer网络自动学习融合特征中包含的丰富信息,实现TFBS的预测。本发明解决了现有的深度学习方法预测精度低、忽视不同类型DNA序列及其间潜在的相互作用、未充分考虑相邻核苷酸间的相互关系以及数据集的数据量存在差异,导致预测转录因子结合位点TFBS方面存在局限性的技术问题。
技术关键词
位点预测方法 转录因子 序列特征 DNA序列 融合特征 多尺度卷积神经网络 滑动窗口 核苷酸 独立特征 sigmoid函数 多尺度特征 卷积特征 编码 卷积模块 正则化技术 注意力 深度学习方法 滤波器
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