基于机器学习的木质素降解微生物物种分类模型及方法

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基于机器学习的木质素降解微生物物种分类模型及方法
申请号:CN202410971272
申请日期:2024-07-19
公开号:CN118888012A
公开日期:2024-11-01
类型:发明专利
摘要
本发明属于数据挖掘与生物信息技术领域,公开了一种基于机器学习的木质素降解微生物物种分类模型及方法:基于序列对齐的卷积神经网络‑双向长短期记忆网络‑注意力机制模型,该模型由输入层、卷积神经网络、双向长短期记忆网络和注意力机制构成。本发明解决了现有技术基于宏基因组学的木质素降解微生物相关研究方法多集中于非机器学习算法,传统的非机器学习算法虽然分类速度快,但容易导致物种分类模糊,难以准确识别微生物分类信息,增加基因序列在物种级别上错误匹配的风险,导致物种类别识别错误,产生大量低丰度假阳性结果,并受训练模型参考数据库的限制,适用于宏基因组木质素降解微生物的物种分类识别问题。
技术关键词
隐马尔可夫模型 注意力机制 滤波器 功能微生物筛选 微生物宏基因组 机器学习算法 动态卷积网络 Softmax函数 构建卷积神经网络 基因序列信息 生物信息技术 长短期记忆网络 开放阅读框 数据 线性单元 序列特征
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