一种刺胞动物门物种基因组Homeobox基因家族鉴定方法、装置、电子设备及存储介质

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一种刺胞动物门物种基因组Homeobox基因家族鉴定方法、装置、电子设备及存储介质
申请号:CN202411044112
申请日期:2024-07-31
公开号:CN118918963A
公开日期:2024-11-08
类型:发明专利
摘要
本发明涉及生物信息领域,具体而言,涉及一种刺胞动物门物种基因组Homeobox基因家族鉴定方法、装置、电子设备及存储介质。该方法包括:S1.构建模式生物基因组Homeobox基因家族保守结构域序列的隐马尔可夫模型数据库;S2.提取刺胞动物门物种的基因组候选Homeobox基因;S3.基于Homeobox基因家族保守结构域序列的隐马尔可夫模型数据库,对刺胞动物门物种基因组候选Homeobox基因的蛋白序列进行同源检索;S4.整合同源检索结果,基于比对期望值进行排序,筛选最佳比对。该方法对刺胞动物门物种基因组Homeobox基因家族能够进行全面鉴定,具有通用性,分类效率高,不易出现假阳性。
技术关键词
基因 家族 非易失性计算机可读存储介质 计算机可执行指令 电子设备 隐马尔可夫模型 线虫动物门 秀丽隐杆线虫 序列 节肢动物门 黑腹果蝇 鉴定装置 生物 处理器通信 斑马鱼 蛋白 模式
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