一种改造任意多肽序列为抗菌肽的方法

本发明公开了一种改造任意多肽序列为抗菌肽的方法，属于生物信息技术领域。本发明开发了用于预测多肽的抗菌活性分数的超图神经网络预测器，对预训练蛋白质语言模型进行偏向于捕捉抗菌肽序列特征的微调训练，并训练用于选择多肽序列中的待突变氨基酸位点的策略网络；对于任意起始多肽序列，首先通过策略网络选择待突变氨基酸位点，然后由微调后的蛋白质语言模型给出该位点突变后氨基酸类型，再由超图神经网络预测器预测突变后序列的抗菌活性分数，迭代执行该过程，直到获得理想的抗菌肽序列输出。该方法有能力将任意多肽序列改造为抗菌肽，改造后多肽的抗菌活性得分获得大幅度提升，可应用于抗菌药物的实际开发，为解决耐药细菌感染奠定基础。