摘要
本发明公开了一种基于单细胞转录组皮尔森残差的细胞状态分析方法和系统,包括根据单细胞测序仪,采集微生物细胞群中各微生物细胞的各功能基因的转录本数量,得到微生物单细胞转录组数据;根据微生物单细胞转录组数据和皮尔森残差算法,计算各功能基因对应的皮尔森残差;计算微生物基因组代谢模型中的初始代谢流量解;根据各皮尔森残差和各功能基因的协同调控代谢网格结构,为各生化反应计算对应的加权系数;根据各加权系数,修正各微生物细胞的各生化反应的初始代谢流量,生成对应的代谢流量向量;计算各代谢流量向量与初始代谢流量解的相似性值,输出微生物细胞群的细胞状态分析结果。本发明实现了开放系统中微生物单细胞代谢多样性的精准表征。
技术关键词
单细胞转录组数据
状态分析方法
基因
测序仪
算法
状态分析系统
数据采集模块
网格
数据分布
输出模块
开放系统
矩阵
符号
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