摘要
本发明提供一种基于结构导向的PAM识别关键域祖先序列重建的Cas9蛋白及制备方法,通过整合结构同源搜索、多维度序列对齐进行祖先序列重建,优化基因编辑工具SpaCas9的PAM识别关键域并扩展其识别范围的技术,基于PID的结构信息,进行结构同源筛选,突破序列相似性限制,识别功能同源蛋白。将具有功能同源但不同PAM识别偏好的蛋白的PAM识别关键域进行祖先重建,得到能够兼容更多PAM的变体。
技术关键词
蛋白
序列
基因编辑工具
层次聚类算法
复合物结构
整合结构
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