摘要
本发明公开了一种单细胞ecDNA克隆轨迹的识别方法,基于ecDNA克隆特征识别单细胞ATAC数据中潜在的肿瘤标志物。本发明通过ecDNA识别癌症标志物,可以灵敏地识别肿瘤细胞并进行早期诊断;ecDNA的拷贝数、结构和分布往往在肿瘤细胞中具有较大的异质性。不同肿瘤细胞群体之间可能携带不同类型的ecDNA克隆,本发明有助于揭示肿瘤的演变轨迹及其细胞群体的多样性;本发明通过研究ecDNA的克隆轨迹,可以揭示肿瘤细胞群体在不同阶段中的基因结构变化,从而为癌症的早期筛查和监测提供潜在标志物。
技术关键词
识别方法
拷贝数
轨迹
断点
矩阵
Louvain算法
样本
非线性降维算法
数据
标记基因
对象
条形码信息
代表
可视化方法
肿瘤标志物
肿瘤微环境
染色体
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