摘要
本发明公开了一种基于序列‑结构双通道神经网络的抗菌肽识别方法及系统,该方法将ProtT5提取的氨基酸特征和氨基酸级手工特征进行拼接,得到肽的嵌入并传入到多个Transformer块组成的序列通道来提取肽的序列特征;利用ESM‑Fold预测肽的三维结构来构建邻接图,将ESM‑2获取的氨基酸特征作为邻接图的节点特征,通过融合多头图注意力、残差网络、层归一化和前馈神经网络的结构通道进行逐层提取与增强;对序列特征和结构特征进行最大池化和拼接,然后用于抗菌肽预测。本发明采用多特征融合策略,同时通过引入抗菌肽的三维结构信息,利用双通道架构融合序列和结构特征,有效提高了抗菌肽识别的准确性。
技术关键词
双通道神经网络
抗菌肽
识别方法
序列特征
三维结构
前馈神经网络
手工特征
注意力
节点特征
Sigmoid函数
残差网络
双通道架构
编码块
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融合策略
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