基于麻雀搜索算法在GWAS数据中检测上位性的方法

本发明涉及计算机科学、生物学技术领域，特别涉及一种基于麻雀搜索算法在GWAS数据中检测上位性的方法，包括载入GWAS数据，计算最大上位性阶数与列联表最大长度；初始化麻雀群体的位置；计算群体中麻雀的适应度；更新发现者的位置；更新追随者的位置；生成新的麻雀；在群体中筛选麻雀检测上位性；判断是否陷于局部最优；生成结果。上述方法能够全面评估与疾病状态相关的SNP组合，提升了分析深度；能够自动识别与疾病状态显著相关的上位性相互作用的阶数，更加符合实际需求；在迭代中基于SNP权重向量生成新的个体，并根据检测结果在每次迭代中更新SNP权重向量，引导群体的进化方向；解决了检测上位性相互作用时的假阳性问题。